18世纪的法国是一个封建专制统治极端严酷的国家，在教育领域，传统的古典主义教育占据着主导地位，使学校教育变成与世隔绝的空中楼阁，严重摧残了人的心智的正常发展。天主教会统治着学校教育，教学方法严重背离了儿童身心发展的顺序，使儿童的个性发展受到了严重压抑。为此，卢梭依据人的自然天性，制定了一套教育方法来教育他想象的学生爱弥之，包括以下5个方面：
一、遵循自然法
在养育儿童的过程中，有些母亲过于关心和爱护自己的孩子，而走上了一条背离自然的道路。担心孩子遭受疾病的折磨，就将儿童包裹的严严实实，不给细菌病*任何可乘之机；担心儿童因走路不稳而摔倒，就不让儿童双脚接触地面，时刻抱在怀中。
然而，这些母亲们忽略了一点，就是“使孩子沉浸在温柔舒适的生活里，实际上是在给他们准备苦难；把孩子身上的毛孔都打开，各种疾病就会侵袭他们，使他们长大的时候成为这些疾病的牺牲品”。
母亲爱护自己的孩子是天性使然，是母爱的自然流露，但过分的溺爱不但不利于孩子的积极健康成长，反而容易将孩子培养成心智不健全、身体孱弱的温室花朵。尤其是今日之中国，多数家庭都只有一个孩子，更容易产生溺爱孩子的现象。
正确的做法是遵循自然，“让他们按照自己的本性，不断地自由活动”，教育孩子从小就熟知：胃肠道疼痛会诱发痉挛；剧烈的咳嗽会引发胸闷；多血症会造成血液疾病等等。
儿童就如同自然界中的小树苗一般，躯体比较娇嫩，应该进行适当的身体锻炼，并根据季节的轮转适当添加衣物。父母要教导孩子正确面对自然界的风吹雨打，正如希腊神话中太提斯将自己的儿子阿基里斯浸泡在冥河之中，以便最终使其变成一个刀枪不入、骁勇善战的勇士。
二、游戏法
儿童是活泼好动、好游戏的，要“爱护儿童，帮助他们做游戏，使他们快乐”。通过游戏，对儿童进行教育更易于他们理解和接受。卢梭在对爱弥儿进行感官训练的过程中，多次运用做游戏的方式来实现教育的目的。
做夜间游戏，帮助克服了爱弥儿对黑夜的恐惧，同时还锻炼了他的触觉，以及在黑暗中做出理智判断的勇气和精神；赛跑的游戏，教会了爱弥儿与别人分享自己的奖品，并锻炼了他用眼睛判断距离和大小的能力；装饰房子的游戏，使爱弥儿领略了色彩搭配的艺术，并掌握了绘画的技巧。
游戏是儿童接触世界，接触他人的一种方式，通过游戏进行教育，不仅符合儿童爱玩的天性，同时也乐于他们接受，取得事半而功倍的效果。
三、榜样法
儿童具有很强的模仿能力，父母或者教师在孩子面前一定要做好榜样模范作用。作为父母，为人处世要善良公正，要时刻以仁爱之心对待他人，孩子在耳濡目染之下也会沿袭父母的做法。作为教师，应该谨言慎行，不能只知说教，卖弄学问。
面对爱夸耀、爱卖弄的教师，儿童可能会故意提问一些刁钻的问题以显示自己的“博学”，或者说出一些不符合其心智年龄的成熟且杂乱无章的话语，最终失掉自己童真包容的一面。家庭教师作为孩子成长和教育的陪伴者，更应该注意自己的一言一行，即使面对孩子的错误行为也要克制好自己的情绪，以免因为冲动而引发不良后果。
此外，儿童由于天性使然，可能会产生种种天真烂漫，甚或异想天开的想法，教师和家长应注意不要当着孩子的面谈论孩子的天真言行，即使要谈论，也应该避开儿童。作为合格的陪伴着，要做到严格要求自己，同时要懂得保护儿童，做儿童行为的标杆和生活中的良师益友。
四、自然后果法
自然后果法是卢梭用来惩罚孩子罪恶行为的一种方法，但“不能为了惩罚孩子而惩罚孩子，应当使他们觉得这些惩罚正是他们不良行为的自然后果”。孩子由于是非观念淡薄，抑或是持有一种错误的是非观，在做错事之后，他们自己可能并不觉着自己做错了，或会感觉自己年龄还小，即便做错了事也不必承担后果。
面对孩子的错误行为，卢梭提出要对孩子的失当行为加以惩罚，让他们明白如果做错事却不承认不仅会遭到别人的指责，而且以后即使他们没有做错事也会被别人不由分说地指责干了坏事。
如果他打坏了屋中的桌椅，不要着急修理或者买新的桌椅，而要让他感受一下没有桌椅的不方便；如果孩子打破了自己房间的窗户，不要立即更换，让他感受一下昼夜的冷风和雨雪；如果修好之后他再次打破，直接将他送到一个没有窗户的小黑屋里，任其呼喊也不予理睬，直到他意识到没有窗户的不方便，承认自己的错误并保证以后不会再犯这样的错误，才还其自由。
五、自然观察法
儿童的好奇心非常强烈，而他们所寻求的好奇对象的答案，较之于阅读刻板的教科书，通过在大自然中做充分完备的观察更容易获得的。卢梭认为，“不应该让孩子复习这复习那，他们唯一的功课就是到大自然的淳朴环境中去学习和实践”。自然界中首先会引起儿童好奇心的就是地球，也就是自己生活居住的环境，其次就是太阳。
卢梭让爱弥儿阅读《鲁滨逊漂流记》，感受鲁滨逊在孤岛上的利用环境来维持生命的故事，帮助其理解地球；通过早起等待旭日东升，观察阳光冲出地平线时一切事物由昏暗变为光明的过程，来了解日出；通过傍晚静候夕阳西下，欣赏漫天绚烂多彩的晚霞逐渐淹没于地平线的景象，来了解日落。
由于好奇心的驱使，孩子在自然界中经过自己的亲身感受，可以帮助他们更好的理解问题或者现象产生的原因、过程乃至结果。书本中的知识多是前人所积累的经验，读起来枯燥无味；而自然界包罗万象，且丰富多彩，通过观察其中的一草一木、一山一水不仅可以触动儿童各种感官的发展，还能刺激儿童大脑的运转，迸发出多种思想的火花。
以上主要分析了遵循自然、游戏、榜样、自然后果和自然观察5种教育儿童的方法。当然，在儿童的教育过程中，还有诸如循序渐进法、需要的法则、实践法、因材施教、有节制的自由等多种教学方法。卢梭在教育爱弥儿的过程中，强调要顺应天性。
由于好奇心重、模范能力强、好游戏等特性，卢梭注重在自然中通过身临其境和设身处地的感受来教育爱弥儿；通过游戏达到强身健体和锻炼感官的目的；通过家庭教师的榜样作用来陶冶和培养爱弥儿之性情；通过自然后果法来惩罚做错事的爱弥儿。卢梭所选择的教育方法完全根据爱弥儿的具体发展状况而定，更易于爱弥儿接受，也更容易实施。