腺苷(m6A)N6位点的甲基化是哺乳动物蛋白编码mRNA中最常见的RNA修饰，是一种具有多种重要生物学功能的可逆修饰。m6A在胃肠道(GI)癌中的潜在修饰机制尚不清楚。本文对胃肠道中已知的9种m6Awriter、erasers和reader蛋白进行了全面的分子层面分析。数据概览
TCGA数据库+GEO数据库分析方向
用cBioportal进行基因改变及通路分析。STRING分析m6A调控因子及其相关通路蛋白网络，MEGA7构建系统发生树，SRAMP预测m6A修饰位点。m6ASNP分析m6A相关SNP。此外实验部分使用m6A-seq、real-timePCR和phospho-mapk阵列验证m6A在其通路的调控。下面将以具体方法和数据结果阐述：到目前为止，在多个哺乳动物基因的转录本中，超过个m6A位点已经通过甲基化RNA免疫沉淀测序(MeRIP-Seq)进行了鉴定。一些关键研究表明，在胶质母细胞瘤、肺癌、肝癌、乳腺癌等肿瘤中，核心基因的改变影响着肿瘤的发生、癌细胞的增殖、肿瘤微环境和预后。然而，在大多数人类癌症中，这些m6A调控因子的生物学功能和关键靶基因仍不清楚。近年来，SNP，表观修饰遗传等作为研究对象的胃肠道肿瘤的重要调控因子逐渐被发现，但是m6A在恶性肿瘤中的生物学功能和机制的研究进展还很少。所以，本文研究了五种GI亚型(食道、胃、结直肠、肝脏和胰腺)与m6Awriter、reader和eraser蛋白之间的相关性。首先，从TCGA数据库(