秋季是消化道疾病多发时节，其中以腹泻为多见。秋季腹泻大致分为以下几种。
有一种秋季腹泻是由肠炎、痢疾、食物中*引起的腹泻，由细菌或细菌产生的*素引起。起病较急，主要表现为呕吐，腹泻，伴有阵阵腹痛，一昼夜大便十多次甚至二三十次可以迁延一周左右。数日后腹泻减轻，可以不治而愈。腹泻期间需及时补充液体，防止与纠正脱水和电解质紊乱。针对这种腹泻，入秋后要注意注意个人卫生、勤洗手、多喝水，尽量不要吃不太健康、卫生的食品，小心病从口入。
还有一种常见的秋季腹泻表现为受凉以后有腹痛，随之泄泻，泻后好转，一般多于早晨起床后发作多见。原因多是由于夜间腹部受凉，痉挛导致肠蠕动加快，从而出现腹泻。腹泻后，肠道内压力减轻，腹痛也随之缓解。入秋后，昼夜温差大，高低温差甚至可达10度。早晚应注意保暖，及时增加衣物。夜间最好窗户关闭，如果开窗睡觉，窗子不要正对着头部，不要开得太大，尤其是老人和孩子。换掉竹席使用床单，盖好被子，下半夜温度降低容易着凉，引起感冒和腹泻。从中医角度讲，一日数次，大便不臭，神疲乏力，面色萎*，胃口不是很好的患者，可能是脾胃虚弱，入秋后早晨起来可以喝一杯热水。避免喝凉水及生冷食物，包括空腹吃水果、凉茶、大闸蟹等。
秋季锻炼也要有讲究，天气凉爽，锻炼的人明显多了起来。肠胃虚弱人士，需要注意等温度升高点再开始锻炼，避免一冷一热，锻炼完后要赶紧更换衣服，有条件者可以冲个澡。
除了上述这些原因，还要两类腹泻需要注意。一是食物不耐受，特别是过敏体质的人，秋季抵抗力下降，造成部分食物难以消化，从而引起腹泻。这种情况要对可能造成腹泻的食物暂时忌口。另一种是由心理因素引起的腹泻，秋季万物萧条，情绪出了问题会导致植物神经系统及内分泌系统变化，影响胃肠系统，造成腹泻。建议平时多运动，运动可以增加愉悦感，强壮身体的同时也让心情得到了放松。
腹泻比较严重的或者持续一周以上的，最好的办法是看医生，不要自己胡乱吃止泻药或者抗生素，应该在医生的指导下用药。免得药吃得不对症，腹泻没止住，还造成了肠道菌群的紊乱。
